1、專業設計環節的缺失
設計是潔（jié）淨室施工和運行（háng）的基礎和前提，是極為重要的一部分工作，應由有潔淨室設計資質公司（sī）的專（zhuān）業設計人員承擔。
許多企業對設計和施工的關係不理解，往往重（chóng）施工輕設計，同時出（chū）於降低（dī）費用考慮幹脆就省略設（shè）計環節，由（yóu）施工單位一並（bìng）代勞。
而施工人員大多不具備專業（yè）設計水平，加上對醫療器械行業要求不了（le）解，出現（xiàn）上述諸多問題（tí）就不足為奇了。
2、利益因素的影響
目前從事潔淨工程（chéng）施工的單位很多，為了中標大家互相壓價，加上甲方（廠家）對淨化也不是特別了解，隻能（néng）大概提出一些要求，然後就考慮價格（gé）問題了。
於是（shì），低價中（zhōng）標的（de）施工單位為降低成本，減小淨化麵積，盡量壓縮輔助用（yòng）房，個別企業甚至簡化到就一個送潔淨風（fēng）的操作間。
另一方麵，施（shī）工（gōng）方為加大保險係數成倍（bèi）提高風機風（fēng）量，通過（guò）提高換氣次數提高潔淨度級別，往往提高幾倍甚至一（yī）個數量級，大大增加了日（rì）後（hòu）的運行維護費用。
3、解決途徑
選擇資質的設計（jì）和施工單（dān）位。
良好的設計和施工既可以達（dá）到生產相應產品的環境（jìng）要求，同時可以節約能（néng）源降低運（yùn）行成本，從長遠來看企業（yè）是獲益的。
潔淨室設計應做到（dào）順應工藝流程、合理選擇各類設備和（hé）裝置、盡力實現人（rén）流和物（wù）流的順暢短捷、氣流流型選擇得當（dāng）、淨化空（kōng）調係統配置（zhì）合理、各種特殊要求的技（jì）術措施得當，潔淨廠（chǎng）房的平麵、空間布置合理，從而實（shí）現可靠經濟運行的潔淨廠房設施。
目前，具有潔淨（jìng）室設計資質的公司（sī）較多，企業可以（yǐ）比較（jiào）選擇，確定以（yǐ）後應將產品工藝要求明示對方，同時簽訂合（hé）同。
設（shè）計一般可參照《潔淨廠房設計規範》（GB50073-2001）和《無菌醫療器具生產管理規範》（YY0033-2000）。
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